Rund um Blaubeuren sind durch das Jurameer vor 150 Millionen Jahren eine ganze Reihe von größeren und kleineren Höhlen entstanden, die durch Rinnen, Rissen und Klüften miteinander verbunden sind. Dadurch ist ein einzigartiges Höhlensystem entstanden das von vielen Wissenschaftlern gerne besucht wird.
Die populärste sind die Blautopf- und Vetterhöhle, die zum GeoPark Schwäbische Alb zählen.